Gimnastika u reakciji fundamentalnoj za biohemiju!

Očekivali su da vide uobičajenu hemijsku reakciju; otkrili su pravi ples atoma!

Posle tri godine proučavanja naučnici sa Teksaškog univerziteta i instituta za fiziku univerziteta u Freiburg-u (Nemačka) su otkrili da je jedan tip hemijske reakcije (fundamentalne za biohemiju) više složen no što se do sad mislilo.

Saznanja o SN2 reakciji na atomskom nivou mogu značiti bolje lekove i bolje razumevanje ćelijskog metabolizma. "Razumevanje ove vrste reakcije može nam pomoći da predvidimo hemijske promene u ćeliji i da razumemo kako promene na molekularnom nivou utiču na funkciju ćelije u celini. "Uzimajući lekove, menjate hemiju ćelije, menjate tok hemijskih procesa u njoj. Tačno razumevanje SN2 reakcija može nas dovesti do značajnih promena u pravljenju lekova."

Tim je koristio superkompjutere da simulira šta će se tačno desiti u SN2 reakciji kada hloridni jon stupi u kontakt sa metil-jodidom (CH₃I). "Otkrili smo fundamentalno nov mehanizam reakcije, koji nije bilo moguće otkriti bez kompjuterske simulacije. Otkrili smo zanimljiv novi način pomeranja atoma pre reakcije. Nisam mogao zamisliti kako se zaista ova reakcij odvija pre no što sam video simulaciju."

Umesto uobičajene linearne reakcije kod koje hloridni jon izbija atom joda, pronađeno je da jon hlora zapravo kružno obilazi čital molekul CH₃I udarajući ga sve dok jodidni jon ne ispadne. Naučnici nisu očekivali da vide tako kompleklsnu gimnastiku.

"Ove simulacije pomažu nam da shvatimo kako atomi raguju i stvaraju molekule i kako kataliza deluje."

Izvor:

• ScienceDaily